Genoscope : A la recherche des organismes fixateurs d’azote des océans
Source(s): Genopole
Les milliers d’échantillons prélevés lors de l’expédition Tara Oceans continuent de livrer régulièrement leur flot de révélations sur le plancton marin. La dernière en date, publiée dans Nature Communication en juillet 2021, est la découverte par une collaboration internationale incluant le Genoscope, de nouveaux organismes capables de fixer l’azote atmosphérique et de le rendre ainsi […]
Les milliers d’échantillons prélevés lors de l’expédition Tara Oceans continuent de livrer régulièrement leur flot de révélations sur le plancton marin. La dernière en date, publiée dans Nature Communication en juillet 2021, est la découverte par une collaboration internationale incluant le Genoscope, de nouveaux organismes capables de fixer l’azote atmosphérique et de le rendre ainsi disponible pour les autres organismes vivants.
L’analyse par intelligence artificielle de plus de 2 millions d’images de microscopie optique a été combinée à l’exploration des quantités massives de séquences d’ADN extraites des échantillons de Tara. Cette étude sans précédent a livré une vue générale de la diversité et de la distribution des organismes fixateurs d’azote des océans. Les chercheurs ont par exemple repéré des régions océaniques de forte activité où ces organismes semblent s’associer.
Eric Pelletier, chercheur au Genoscope impliqué dans cette étude souligne qu’« il s’agit de l’une des toutes premières analyses à haut débit et à grande échelle d’organismes microbiens dans leur environnement naturel qui croisent des données omiques, c’est à dire des informations sur leur génome, et des données d’imagerie qui permettent de révéler leur forme et leur taille. Ceci ouvre la voie à une nouvelle ère pour les études environnementales ».
Référence
Global distribution patterns of marine nitrogen-fixers by imaging and molecular methods, Nature Communications 2021
https://doi.org/10.1038/s41467-021-24299-y