La COVID19 Disease Map : Carte informatique des mécanismes biologiques du Covid-19
Source(s): Evry-Sénart Science et Innovation
Le Dr. Anna Niarakis, enseignant-chercheur en bio-informatique et biologie computationnelle des systèmes, au laboratoire genopolitain GenHotel de l’Université d’Évry, fait partie des quatre chercheurs à coordonner le projet international COVID-19 Disease Map. Cette carte informatique, interactive et en libre accès, regroupe tous les mécanismes moléculaires connus de la maladie Covid-19
COVID-19 Disease Map
Cette carte est le fruit de l’effort collectif d’une communauté représentant aujourd’hui 277 chercheurs de 120 institutions dans 30 pays. Le Dr. Anna Niarakis, enseignant-chercheur au sein du laboratoire génopolitain GenHotel de l’Université d’Évry, fait partie des quatre coordinateurs de ce grand projet.
La plateforme compile, sous forme de carte interactive, l’ensemble des données disponibles sur les interactions moléculaires entre le virus et l’organisme. Elle aide ainsi à comprendre le rôle de ces interactions dans les mécanismes complexes de la maladie : processus d’infection, voies biologiques et types de cellules affectés, prolifération virale, réponse inflammatoire, etc.
En plus de la visualisation des voies biologiques impliquées, l’utilisateur peut agir sur chaque élément, protéine, gène…, en observant l’effet produit par son activation ou sa suppression. Elle met également à disposition des scientifiques des modèles informatiques pour simuler et analyser l’effet de perturbations comme une réaction inflammatoire, la prolifération du virus…, ou l’effet d’un médicament.
L’objectif
L’objectif est de gagner en efficacité pour améliorer notre compréhension du Covid-19 et accélérer le développement de diagnostics et de thérapies.
Le défi est d’associer vitesse et qualité dans la course contre la pandémie !
La participation active de plus de 250 scientifiques couvre tous les champs d’expertise nécessaires à la compréhension du Covid-19 :
- les aspects cliniques et moléculaires de la maladie,
- la caractérisation des interactions moléculaires et la construction des diagrammes de biologie des systèmes représentant les mécanismes de la maladie,
- l’exploration de la littérature médicale
- l’intégration de diverses bases de données et les compétences bio-informatiques,
- la modélisation informatique pour analyser les perturbations liées aux maladies à l’aide d’approches de biologie des systèmes.
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